Indexed, Peer-Reviewed Publications

• E. Celms, J. Barzdins, A. Kalnins, P. Barzdins, A. Sprogis, M. Grasmanis, S. Rikacovs. DSL approach to deep learning lifecycle data management. Baltic Journal of Modern Computing, Volume 8, Issue 4, 2021, Pages 597-617. (SCOPUS) DOI, link
• K. Podnieks. Philosophy of Modeling in the 1870s: A Tribute to Hans Vaihinger. Baltic Journal of Modern Computing, Volume. 9 (2021), Issue 1, pp. 67–110, (SCOPUS, Web of Science). ISSN: 22558942 DOI, link
• B. Abedi-Ardekani, D. Nasrollahzadeh, L. Egevad, R.E. Banks, N. Vasudev, I. Holcatova, C. Povysil, L. Foretova, V. Janout, D. Mates, V. Jinga, A. Petrescu, S. Milosavljevic, M. Ognjanovic, S. Ognjanovic, J. Viksna, A.Y. Warren, M. Lathrop, Y. Riazalhosseini, C. Carreira, E. Chanudet, J. McKay, P. Brennan, G. Scélo. Morphological findings in frozen non-neoplastic kidney tissues of patients with kidney cancer from large-scale multicentric studies on renal cancer. 2021, Virchows Archiv, 478 (6), pp. 1099-1107. (SCOPUS, Web of Science). ISSN: 09456317 DOI
• K. Čerāns, J. Ovčiņņikova, U. Bojārs, M. Grasmanis, L. Lāce, A. Romāne. Schema-Backed Visual Queries over Europeana and Other Linked Data Resources. ESWC 2021 Satellite Events. Springer LNCS, Vol.12739, pp.82-87. (SCOPUS) ISBN: 978-303080417-6 DOI, link Grant: lzp-2020/2–0188
• E. Ozolinš, K. Freivalds, A. Šostaks. Matrix Shuffle- Exchange Networks for Hard 2D Tasks. 2021 International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN), 2021, pp. 1-8. (SCOPUS). ISBN: 978-073813366-9 DOI, link Grant: lzp-2018/1-0327
• A. Draguns, E. Ozolins, A. Sostaks, M. Apinis, K. Freivalds. Residual Shuffle-Exchange Networks for Fast Processing of Long Sequences. Proceedings of the AAAI Conference on Artificial Intelligence, 35(8), 7245-7253. (Web of Science) link ISBN: 978-1-57735-866-4 Grant: lzp-2018/1-0327
• E. Rencis. Application of a Configurable Keywords-Based Query Language to the Healthcare Domain. In Journal of Advances in Information Technology (JAIT, ISSN: 1798-2340), May 2021, Vol. 12, No. 2, pp. 142-147. (SCOPUS). ISSN: 17982340 DOI, link Grant: 1.1.1.2/VIAA/1/16/218
• K. Čerāns, J. Ovčiņņikova, M. Grasmanis, L. Lāce, A. Romāne. Visual Presentation of SPARQL Queries in ViziQuer. In Proc. of VOILA! 2021, CEUR Workshop Proceedings Vol. 3023, pp. 29-40., (SCOPUS). ISSN: 1613-0073 link
• E. Kalnina, D. Kosarevskis, A. Sostaks. Find-replace as a service of graph-based DSL tool development framework. In Proceedings of the 1st International Workshop on Foundations and Practice of Visual Modeling, Bergen, 22 June, 2021 co-located with STAF 2021, CEUR Workshop Proceedings Vol. 2999, pp. 65-76. (SCOPUS) ISSN: 1613-0073 link
• G. Melkus, K. Cerans, K. Freivalds, L. Lace, D. Rituma, J. Viksna. Analysis of dynamics and stability of hybrid system models of gene regulatory networks. ACM International Conference Proceeding Series, CSBio2021: The 12th International Conference on Computational Systems-Biology and Bioinformatics, October 2021, pp. 1-10. To be indexed by SCOPUS. ISBN: 978-1-4503-8510-7 DOI, link

Posters in International Conferences

• J. Viksna, K. Cerans, K. Freivalds, L. Lace, G. Melkus, D. Zajakina. Analysis of dynamics and stability of hybrid system models of gene regulatory networks. ISMB/ECCB 2021, NetBio COSI, July 25-30 2021. Grant: LZP-2019/1-0432
• G. Melkus, L. Lace, K. Cerans, D. Zajakina, K. Freivalds, J. Viksna. Topological analysis of phage regulatory networks in hybrid system models: what can we learn? ISMB/ECCB 2021, SysMod COSI, July 25–30 2021. Grant: LZP-2019/1-0432
• J. Viksna, K. Cerans, K. Freivalds, L. Lace, G. Melkus, D. Zajakina. Hybrid gene regulation models of circadian cycles. RECOMB 2021, August 29 – September 1, 2021. Grant: LZP-2019/1-0432
• G. Melkus, K. Cerans, K. Freivalds, L. Lace, D. Rituma, J. Viksna. Analysis of dynamics and stability of hybrid system models of gene regulatory networks. The 12th International Conference on Computational Systems-Biology and Bioinformatics CSBio2021, (Virtual), October 2021.

Publications in the Annual Conference of the University of Latvia

• E. Celms, K. Čerāns, K. Freivalds, P. Ķikusts, L. Lāce, G. Melkus, M. Opmanis, D. Rituma, P. Ručevskis, J. Vīksna. "Applications of graph-based modelling and analysis methods in systems biology." Referāts LU 79. konferencē, Plenārsēde. Inovatīvas informācijas tehnoloģijas. 2021. gada 5. februāris. link
• G. Melkus. "Bakteriofāgu regulatoro tīklu analīze ar hibrīdiem modeļiem." Referāts LU 79. konferencē, Sekcijas sēde "Datorzinātne un informācijas tehnoloģijas." 2021. gada 12. februāris. link
• A. Sproģis, G. Bārzdiņš, J. Bārzdiņš, A. Kalniņš, S. Rikačovs, E. Celms, M. Grasmanis. "Dziļās mašīnmācīšanās modeļi un to dzīves cikla pārvaldības ietvars multimediju datu apstrādei." Referāts LU 79. konferencē, Sekcijas sēde "Datorzinātne un informācijas tehnoloģijas." 2021. gada 12. februāris. link
• E. Ozoliņš, S. Kozlovičs, A. Draguns, E. Gaile, R. Zakovskis, K. Freivalds. "Mērķa-virzīta neironu tīklu arhitektūra SAT risināšanai." Referāts LU 79. konferencē, Sekcijas sēde "Datorzinātne un informācijas tehnoloģijas." 2021. gada 12. februāris. link
• R. Zakovskis, E. Ozoliņš, A. Draguns, E. Gaile, K. Freivalds. "Efektīvas rekurentā neironu tīkla šūnas izstrāde." Referāts LU 79. konferencē, Sekcijas sēde "Datorzinātne un informācijas tehnoloģijas." 2021. gada 12. februāris. link
• E. Gaile, A. Draguns, E. Ozoliņš, R. Zakovskis, K. Freivalds. "Ceļojošā tirgotāja problēmas tuvināta risināšana ar neironu tīkliem." Referāts LU 79. konferencē, Sekcijas sēde "Datorzinātne un informācijas tehnoloģijas." 2021. gada 12. februāris. link
• E. Kalniņa. "Concrete syntax-based find for graph-based modeling languages." Referāts LU 79. konferencē, Sekcijas sēde "Matemātisko metožu pētījumu izcilībai." 2021. gada 29. janvāris. link

Other publications

• K. Sergejs A Web-Based Operating System for Integrating Heterogeneous Data and Code Using Semantic Web Technologies as Interlingua. The European Data Conference on Reference Data and Semantics (ENDORSE 2021), Virtual event, 16-19 March 2021, Luxembourg: Publications Office of the European Union, 2021 ISBN: 978-92-78-42492-3 DOI, link Grant: 1.1.1.2/VIAA/1/16/214

Preprints

• E. Ozolins, K. Freivalds, A. Draguns, E. Gaile, R. Zakovskis, S. Kozlovics. Goal-Aware Neural SAT Solver. arXiv preprint arXiv:2106.07162 link
• R. Zakovskis, A. Draguns, E. Gaile, E. Ozolins, K. Freivalds. Gates are not what you need in RNNs. arXiv preprint arXiv:2108.00527 link

Teaching materials

• M. Opmanis, R. Opmanis, P. Pakalns, J. Vihrovs, N. Vilciņš. Informātikas (programmēšanas) olimpiāžu uzdevumu un to risinājumu krājums (2017.-2020. gads). Valsts izglītības satura centrs, 2021. ISBN 978-9934-24-033-1
• M. Avotiņa, M. Opmanis, R. Opmanis, M. Valdats, A. Zīlīte. Matemātikas olimpiāžu uzdevumu un to risinājumu krājums (2017.-2020. gads). Valsts izglītības satura centrs, 2021. ISBN 978-9934-24-032-4
• V. Detlovs, K. Podnieks. Introduction to Mathematical Logic, Edition 2021. Textbook for students, 2000–2021, 261 pp. link